Investigador descubre secuencias genéticas de SARS-CoV-2 eliminadas el año pasado

En junio de 2020, las secuencias genéticas de 241 muestras de virus tomadas en Wuhan al comienzo de la epidemia desaparecieron de una base de datos científica en línea.. Al analizar los archivos almacenados en Google Cloud, Jesse Bloom, un virólogo de la Universidad de Seattle, señala que pudo recuperar trece.

Estas secuencias genéticas habían desaparecido de una base de datos en línea llamada Sequence Read Archive, mantenida por los Institutos Nacionales de Salud (NIH). El virólogo de la Universidad de Seattle, el Dr. Bloom, explica que notó su ausencia al analizar una hoja de cálculo disponible en un estudio publicado en mayo de 2020 en la revista PeerJ. Durante este trabajo, los autores identificaron 241 secuencias genéticas de SARS-CoV-2 hasta finales de marzo de 2020 como parte de un proyecto en la Universidad de Wuhan.

Esta famosa hoja de cálculo indicaba que los autores del estudio habían subido sus secuencias a la base de datos. Sin embargo, al escribir esta información en la barra de búsqueda, el investigador no la encontró.

No había “ninguna razón científica” para eliminarlos.

Durante su trabajo de investigación, el investigador señaló que estas 241 secuencias eliminadas habían sido recogido por el Dr. Aisu Fu, Hospital Renmin en Wuhan.

Mientras examinaba la literatura científica, Bloom se encontró con una “versión preimpresa” de otro estudio realizado en marzo de 2020 por el mismo investigador. Publicado tres meses después en la revista Small, este estudio se centró en mutaciones de virus específicas aisladas en 45 frotis nasales tomados de pacientes ambulatorios en Wuhan (sin área especificada) al comienzo de la epidemia (sin fecha especificada).

Dicho esto, para el Dr. Bloom, estas muestras probablemente fueron la fuente de las infames 241 secuencias faltantes. Luego notó que el archivo de lectura de secuencia estaba haciendo una copia de seguridad de la información en Google Cloud. Gracias a estos datos, explica que finalmente fue capaz de recuperar trece de las 241 secuencias inicialmente eliminadas.

Este nuevo estudio, que aún no ha sido revisado por pares, naturalmente hace preguntas sobre por qué se eliminaron estas imágenes originales. Para Jesse Bloom, los investigadores tenían “no hay razón científica para hacerlo“. Por tanto, según él, parece probable que estas secuencias fueran “eliminado para ocultar su existencia“.

virus de los murciélagos
Crédito: 13848407 / Pixabay

Regresa al origen

Estos datos podrían resultar muy valiosos en esfuerzos para rastrear el origen del virus. Para determinarlo, los investigadores deben aislar el “primer virus” del que nacieron todas las demás cepas. Hasta ahora, las primeras secuencias se habían muestreado principalmente de casos registrados en diciembre de 2019 en el mercado de Huanan en Wuhan, considerado durante mucho tiempo el punto de partida de la epidemia. Sin embargo, las primeras secuencias genéticas aisladas de este mercado incluyeron tres mutaciones ausentes de ciertas secuencias de virus muestreadas semanas después fuera del mercado. Aquí, el metraje encontrado por Jesse Bloom también fue desprovisto de estas mutaciones.

En el Times, el investigador señala que este nuevo anuncio no refuerza ni descarta la hipótesis de que el SARS-CV-2 pudo haberse filtrado de un laboratorio P4. Además, los virus que carecen de estas tres mutaciones se corresponden más estrechamente con los coronavirus que se encuentran en los murciélagos en herradura, que muchos sospechan que están en el origen de la pandemia.

Por otro lado, refuerza las sugerencias anteriores de que este virus podría han circulado en Wuhan antes de las primeras declaraciones oficiales en diciembre de 2019 (ya que los de Wuhan ya se habían transferido). El uso del condicional está justificado en la medida en que no se sabe con precisión dónde y cuándo se recolectaron las muestras relacionadas con estas secuencias genéticas recuperadas. Sin embargo, esta información es obviamente crucial para rastrear el origen del virus.


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